Что стоит за нашим COVID

Калифорнийский университет в Дэвисе «с честью проходит тест на COVID», — сказала Стефани Руле из MSNBC, используя игру слов, завершая недавнее интервью с профессором Брэдом Поллоком, заместителем декана по общественному здравоохранению, о университетской программе тестирования на COVID-19.

Программа тестирования слюны началась 14 сентября, когда студенты начали переезжать в общежития кампуса на осеннюю четверть, а затем расширилась, чтобы служить обществу через Healthy Davis Together.

Ранее в этом месяце Центр генома Калифорнийского университета в Дэвисе протестировал 100-тысячный образец слюны. Здесь мы рассмотрим, что стоит за тестом и как он возник.

Высокопроизводительные машины количественной ПЦР IntelliQube, использующие технологию «матрица-лента», играют ключевую роль в программе тестирования. Вместо пробирок для образцов или планшетов с лунками машины анализируют ленту с тысячами крошечных лунок, каждая из которых может проводить реакцию ПЦР.

Первоначально разработанные для использования в сельскохозяйственной генетике, машины с магнитной лентой могут выполнять тысячи ПЦР-тестов в день — гораздо больше, чем машины, созданные специально для медицинской диагностики.

Профессор растениеводства Ричард Мишельмор, директор Центра генома, и его команда разработали программу тестирования и предложили ее университетскому городку. Финансирование поступило до 4 августа, чуть больше чем за месяц до прибытия студентов. «Это вызвало огромную мобилизацию в кампусе», — сказал Михельмор.

Прохождение теста включает в себя простое сплевывание в трубку, а результаты обычно возвращаются в течение одного-двух дней. Тест предназначен для людей, у которых нет симптомов COVID-19: учащиеся с симптомами должны обратиться в Службу здоровья и консультирования студентов, а остальные должны обратиться к своим медицинским работникам.

Для проведения тестирования требуется записаться на прием — в ходе онлайн-процесса создается индивидуальный штрих-код, который по прибытии на тестирование сопоставляется со штрих-кодом на вашей пробирке с образцом. Сделайте глоток воды, капните ее обратно в трубку, закройте крышкой, и все готово.

Обезличенные пробирки со штрих-кодом доставляются в Геномный центр, где образцы подвергаются термической обработке для инактивации любого вируса. Частицы вируса SARS-CoV2 хорошо выживают в слюне, отметил Михельмор.

Затем образцы обрабатываются папаиновой протеазой (также известной как тендерайзер для мяса) для снижения вязкости слюны и переносятся в 384-луночные пластиковые планшеты, а затем автоматически переносятся на ленту. Реакция занимает около полутора часов; каждый IntelliQube может выполнить около 6000 тестов за 12-часовой день. Результаты анализируются с помощью облачного программного обеспечения UgenTech FastFinder.

ПЦР-тест адаптирован на основе протоколов, одобренных Управлением по контролю за продуктами и лекарствами. Лаборатория одобрена CLIA как расширение лаборатории студенческого медицинского центра Калифорнийского университета в Дэвисе.

Тест может обнаружить всего 15 копий вируса в микролитре слюны, что ниже порога, который может быть заразным для человека. Первоначально тесты слюны сравнивались с мазками из носа, взятыми в то же время и обработанными в коммерческой лаборатории, но это было прекращено, как только была подтверждена точность теста слюны.

Две отдельные группы технического персонала во главе с менеджером ядра DNA Technology Лутцем Фрёнике работают над проведением тестов в разные дни, а резервная команда выполняет функцию резервного копирования.

Михельмор отметил, что программа тестирования была запущена и запущена в рамках «массивных усилий всего кампуса», в том числе Ральфа Грина из отдела патологии и лабораторной медицины Калифорнийского университета в Дэвисе, Синди Шорцманн, медицинского директора Службы здоровья и консультирования студентов, и Шери Белафски из Калифорнийского университета. Программа медицинского надзора Дэвиса — и многие, многие другие, кто работал над тем, чтобы встать и управлять киосками тестирования, приобретать машины и оборудование, проводить тесты, анализировать и сообщать о результатах.

Хотя Михельмор получил множество запросов от других университетов и предприятий, он отметил, что в настоящее время они не планируют расширять тестирование за пределы Калифорнийского университета в Дэвисе, Дэвисе, других местах в округе Йоло и Калифорнийского университета в Мерседе из-за ограниченных возможностей. Однако он отметил, что ни один из протоколов и рабочих процессов не запатентован и не может быть воспроизведен другими.